1951'de Tokyo'da doğdu. Keio Üniversitesi'nde okudu, aynı üniversitenin edebiyat fakültesinde doktora programını tamamladı; felsefe ve etik alanında uzmanlaştı. Shinshu Üniversitesi ve Chiba Üniversitesi'nde profesörlük yaptı; son olarak Nihon Üniversitesi Beşeri Bilimler ve Bilimler Fakültesi'nde felsefe profesörü olarak görev yaptı.
İlk kitabı 〈Ben〉in Metafiziği (1986), Japon felsefesinde bugün 'dokuzai-ron' (tekil-varoluş kuramı) adıyla sürdürülen tartışmayı başlattı: Dünyada pek çok insan vardır, ama yalnızca biri 'ben' olarak yaşanmaktadır; bu olgu ne psikolojik ne biyolojik bir açıklamayla tüketilebilir. Nagai bunu klasik tekbencilikten (solipsizm) ayırmak için 'dokuzai-sei' (İngilizce metinlerde 'solipsity') kavramını kullandı ve 'ben' ile 〈Ben〉 arasında sürekli bir ayrım yaptı. 2007-2014 arasında Philosophia OSAKA dergisinde İngilizce yayımlanan iki makale dizisi, 'The Opening: A Philosophy of Actuality' ve 'Why Isn't Consciousness Real?', düşüncesinin Japonya dışındaki başlıca kaynaklarıdır.
Wittgenstein'ın Yanlış Teşhisi (2012) Mavi Kitap dönemini, Kant'ın Yanlış Teşhisi dizisi (2025-2026) Saf Aklın Eleştirisi ile Ahlak Metafiziğinin Temellendirilmesi'ni, filozofların doğru soruyu yakalayıp yanlış teşhis koyduğu metinler olarak yeniden okur. 〈Çocuklar〉 İçin Felsefe (1996), 'neden varım?' ve 'neden kötü olmamalıyım?' sorularını çocuğun kendi içinden başlatan bir kitap olarak Japonya'da kuşaklar boyu okundu; Kodansha, otuz yıl sonra 19 Mart 2026'da 'tamamlanmış baskı'sını yayımladı. Manga Felsefe Yapar (2000) ve kurgu biçiminde yazdığı felsefi diyaloglar, felsefenin akademi dışında da yapılabileceğini savunan tavrının ürünleridir.